Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRAFP15056 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRAFP15056 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRAFP15056 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRAFP15056 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRAFP15056 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRAFP15056 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRAFP15056 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRAFP15056 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BRAFP15056 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRAFP15056 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRAFP15056 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRAFP15056 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRAFP15056 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRAFP15056 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRAFP15056 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRAFP15056 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRAFP15056 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRAFP15056 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRAFP15056 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRAFP15056 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRAFP15056 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRAFP15056 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRAFP15056 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRAFP15056 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRAFP15056 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRAFP15056 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BRAFP15056 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BRAFP15056 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRAFP15056 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRAFP15056 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRAFP15056 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRAFP15056 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRAFP15056 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRAFP15056 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRAFP15056 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRAFP15056 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
BRAFP15056 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BRAFP15056 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BRAFP15056 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BRAFP15056 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BRAFP15056 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRAFP15056 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRAFP15056 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
BRAFP15056 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRAFP15056 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRAFP15056 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRAFP15056 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRAFP15056 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRAFP15056 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRAFP15056 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRAFP15056 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRAFP15056 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRAFP15056 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRAFP15056 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRAFP15056 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BRAFP15056 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRAFP15056 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRAFP15056 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRAFP15056 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRAFP15056 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRAFP15056 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BRAFP15056 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRAFP15056 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRAFP15056 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRAFP15056 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRAFP15056 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRAFP15056 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRAFP15056 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRAFP15056 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRAFP15056 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRAFP15056 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRAFP15056 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRAFP15056 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRAFP15056 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BRAFP15056 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BRAFP15056 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRAFP15056 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRAFP15056 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRAFP15056 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRAFP15056 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRAFP15056 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRAFP15056 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRAFP15056 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRAFP15056 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRAFP15056 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRAFP15056 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRAFP15056 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRAFP15056 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRAFP15056 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRAFP15056 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRAFP15056 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRAFP15056 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRAFP15056 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRAFP15056 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRAFP15056 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRAFP15056 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRAFP15056 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRAFP15056 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BRAFP15056 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms