Protein–RNA interactions for Protein: P0CX21

YRF1-5, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 5, yeastyeast

Predictions only

Length 1,796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-5P0CX21 FSH3YOR280C 801 nt4.97□□□□□ -1.61
YRF1-5P0CX21 MET10YFR030W 3108 nt4.97□□□□□ -1.61
YRF1-5P0CX21 CDC26YFR036W 375 nt4.96□□□□□ -1.61
YRF1-5P0CX21 EKI1YDR147W 1605 nt4.96□□□□□ -1.62
YRF1-5P0CX21 MRP13YGR084C 1020 nt4.96□□□□□ -1.62
YRF1-5P0CX21 PRE9YGR135W 777 nt4.96□□□□□ -1.62
YRF1-5P0CX21 IRC18YJL037W 675 nt4.96□□□□□ -1.62
YRF1-5P0CX21 NHP10YDL002C 612 nt4.95□□□□□ -1.62
YRF1-5P0CX21 NPY1YGL067W 1155 nt4.95□□□□□ -1.62
YRF1-5P0CX21 ECM34YHL043W 513 nt4.95□□□□□ -1.62
YRF1-5P0CX21 TPO2YGR138C 1845 nt4.95□□□□□ -1.62
YRF1-5P0CX21 NOP4YPL043W 2058 nt4.94□□□□□ -1.62
YRF1-5P0CX21 RTK1YDL025C 1863 nt4.94□□□□□ -1.62
YRF1-5P0CX21 IMD4YML056C 1575 nt4.94□□□□□ -1.62
YRF1-5P0CX21 HSP82YPL240C 2130 nt4.94□□□□□ -1.62
YRF1-5P0CX21 SAS10YDL153C 1833 nt4.94□□□□□ -1.62
YRF1-5P0CX21 TED1YIL039W 1422 nt4.94□□□□□ -1.62
YRF1-5P0CX21 HOM2YDR158W 1098 nt4.93□□□□□ -1.62
YRF1-5P0CX21 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt4.93□□□□□ -1.62
YRF1-5P0CX21 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt4.93□□□□□ -1.62
YRF1-5P0CX21 SHG1YBR258C 429 nt4.93□□□□□ -1.62
YRF1-5P0CX21 ECM16YMR128W 3804 nt4.93□□□□□ -1.62
YRF1-5P0CX21 YHR202WYHR202W 1809 nt4.93□□□□□ -1.62
YRF1-5P0CX21 PAN1YIR006C 4443 nt4.93□□□□□ -1.62
YRF1-5P0CX21 NUS1YDL193W 1128 nt4.93□□□□□ -1.62
YRF1-5P0CX21 MNN11YJL183W 1269 nt4.93□□□□□ -1.62
YRF1-5P0CX21 MDY2YOL111C 639 nt4.93□□□□□ -1.62
YRF1-5P0CX21 MED4YOR174W 855 nt4.93□□□□□ -1.62
YRF1-5P0CX21 RPS9BYBR189W 588 nt4.93□□□□□ -1.62
YRF1-5P0CX21 SOF1YLL011W 1470 nt4.92□□□□□ -1.62
YRF1-5P0CX21 MDM12YOL009C 816 nt4.92□□□□□ -1.62
YRF1-5P0CX21 YJR020WYJR020W 333 nt4.91□□□□□ -1.62
YRF1-5P0CX21 STP22YCL008C 1158 nt4.91□□□□□ -1.62
YRF1-5P0CX21 ORC1YML065W 2745 nt4.91□□□□□ -1.62
YRF1-5P0CX21 YHR212W-AYHR212W-A 204 nt4.91□□□□□ -1.62
YRF1-5P0CX21 YAR061WYAR061W 204 nt4.91□□□□□ -1.62
YRF1-5P0CX21 YMR317WYMR317W 3423 nt4.9□□□□□ -1.62
YRF1-5P0CX21 SHO1YER118C 1104 nt4.9□□□□□ -1.63
YRF1-5P0CX21 YRA2YKL214C 612 nt4.9□□□□□ -1.63
YRF1-5P0CX21 REC104YHR157W 549 nt4.89□□□□□ -1.63
YRF1-5P0CX21 STE13YOR219C 2796 nt4.89□□□□□ -1.63
YRF1-5P0CX21 RRN7YJL025W 1545 nt4.89□□□□□ -1.63
YRF1-5P0CX21 ELM1YKL048C 1923 nt4.89□□□□□ -1.63
YRF1-5P0CX21 RUF5-1RUF5-1 710 nt4.88□□□□□ -1.63
YRF1-5P0CX21 RUF5-2RUF5-2 710 nt4.88□□□□□ -1.63
YRF1-5P0CX21 DNA2YHR164C 4569 nt4.88□□□□□ -1.63
YRF1-5P0CX21 BUD27YFL023W 2391 nt4.88□□□□□ -1.63
YRF1-5P0CX21 TEL2YGR099W 2067 nt4.88□□□□□ -1.63
YRF1-5P0CX21 RFM1YOR279C 933 nt4.88□□□□□ -1.63
YRF1-5P0CX21 GYP6YJL044C 1377 nt4.88□□□□□ -1.63
YRF1-5P0CX21 RSE1YML049C 4086 nt4.87□□□□□ -1.63
YRF1-5P0CX21 YHL026CYHL026C 948 nt4.87□□□□□ -1.63
YRF1-5P0CX21 ERG2YMR202W 669 nt4.87□□□□□ -1.63
YRF1-5P0CX21 LCL2YLR104W 396 nt4.86□□□□□ -1.63
YRF1-5P0CX21 GOT1YMR292W 417 nt4.86□□□□□ -1.63
YRF1-5P0CX21 LEU1YGL009C 2340 nt4.86□□□□□ -1.63
YRF1-5P0CX21 SWP82YFL049W 1872 nt4.86□□□□□ -1.63
YRF1-5P0CX21 YNL320WYNL320W 855 nt4.86□□□□□ -1.63
YRF1-5P0CX21 YBL108WYBL108W 306 nt4.86□□□□□ -1.63
YRF1-5P0CX21 RPO26YPR187W 468 nt4.86□□□□□ -1.63
YRF1-5P0CX21 DRS2YAL026C 4068 nt4.85□□□□□ -1.63
YRF1-5P0CX21 PCA1YBR295W 3651 nt4.85□□□□□ -1.63
YRF1-5P0CX21 CAF120YNL278W 3183 nt4.85□□□□□ -1.63
YRF1-5P0CX21 YGL108CYGL108C 423 nt4.85□□□□□ -1.63
YRF1-5P0CX21 CRZ1YNL027W 2037 nt4.84□□□□□ -1.63
YRF1-5P0CX21 HMF1YER057C 390 nt4.84□□□□□ -1.63
YRF1-5P0CX21 YPT7YML001W 627 nt4.84□□□□□ -1.63
YRF1-5P0CX21 PRE8YML092C 753 nt4.84□□□□□ -1.63
YRF1-5P0CX21 TCB2YNL087W 3537 nt4.84□□□□□ -1.63
YRF1-5P0CX21 ECM32YER176W 3366 nt4.84□□□□□ -1.64
YRF1-5P0CX21 CUE3YGL110C 1875 nt4.84□□□□□ -1.64
YRF1-5P0CX21 MIS1YBR084W 2928 nt4.83□□□□□ -1.64
YRF1-5P0CX21 RAD54YGL163C 2697 nt4.83□□□□□ -1.64
YRF1-5P0CX21 CFD1YIL003W 882 nt4.83□□□□□ -1.64
YRF1-5P0CX21 PDR12YPL058C 4536 nt4.82□□□□□ -1.64
YRF1-5P0CX21 PHO86YJL117W 936 nt4.82□□□□□ -1.64
YRF1-5P0CX21 DUR1,2YBR208C 5508 nt4.82□□□□□ -1.64
YRF1-5P0CX21 MRPS35YGR165W 1038 nt4.81□□□□□ -1.64
YRF1-5P0CX21 INN1YNL152W 1230 nt4.81□□□□□ -1.64
YRF1-5P0CX21 ARO4YBR249C 1113 nt4.81□□□□□ -1.64
YRF1-5P0CX21 NTO1YPR031W 2247 nt4.81□□□□□ -1.64
YRF1-5P0CX21 SET5YHR207C 1581 nt4.81□□□□□ -1.64
YRF1-5P0CX21 FAD1YDL045C 921 nt4.81□□□□□ -1.64
YRF1-5P0CX21 HSP42YDR171W 1128 nt4.81□□□□□ -1.64
YRF1-5P0CX21 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt4.81□□□□□ -1.64
YRF1-5P0CX21 YMR087WYMR087W 855 nt4.81□□□□□ -1.64
YRF1-5P0CX21 GAC1YOR178C 2382 nt4.8□□□□□ -1.64
YRF1-5P0CX21 RAD53YPL153C 2466 nt4.8□□□□□ -1.64
YRF1-5P0CX21 NGL2YMR285C 1548 nt4.8□□□□□ -1.64
YRF1-5P0CX21 TLG1YDR468C 675 nt4.8□□□□□ -1.64
YRF1-5P0CX21 PIR1YKL164C 1026 nt4.8□□□□□ -1.64
YRF1-5P0CX21 SED5YLR026C 1023 nt4.8□□□□□ -1.64
YRF1-5P0CX21 CLD1YGR110W 1338 nt4.8□□□□□ -1.64
YRF1-5P0CX21 ENA2YDR039C 3276 nt4.8□□□□□ -1.64
YRF1-5P0CX21 ENA1YDR040C 3276 nt4.8□□□□□ -1.64
YRF1-5P0CX21 INO80YGL150C 4470 nt4.79□□□□□ -1.64
YRF1-5P0CX21 ACC1YNR016C 6702 nt4.79□□□□□ -1.64
YRF1-5P0CX21 SYF1YDR416W 2580 nt4.79□□□□□ -1.64
YRF1-5P0CX21 SUB2YDL084W 1341 nt4.79□□□□□ -1.64
YRF1-5P0CX21 MCX1YBR227C 1563 nt4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.8 ms