Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHOBTB3O94955 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHOBTB3O94955 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHOBTB3O94955 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RHOBTB3O94955 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHOBTB3O94955 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHOBTB3O94955 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHOBTB3O94955 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOBTB3O94955 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOBTB3O94955 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOBTB3O94955 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOBTB3O94955 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOBTB3O94955 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOBTB3O94955 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOBTB3O94955 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOBTB3O94955 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOBTB3O94955 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOBTB3O94955 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOBTB3O94955 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOBTB3O94955 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOBTB3O94955 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOBTB3O94955 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOBTB3O94955 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOBTB3O94955 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOBTB3O94955 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOBTB3O94955 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOBTB3O94955 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOBTB3O94955 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOBTB3O94955 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOBTB3O94955 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOBTB3O94955 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOBTB3O94955 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOBTB3O94955 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOBTB3O94955 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOBTB3O94955 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOBTB3O94955 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOBTB3O94955 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOBTB3O94955 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms