Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
UFL1O94874 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UFL1O94874 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UFL1O94874 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UFL1O94874 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UFL1O94874 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UFL1O94874 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
UFL1O94874 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UFL1O94874 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
UFL1O94874 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
UFL1O94874 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UFL1O94874 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UFL1O94874 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UFL1O94874 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UFL1O94874 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UFL1O94874 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UFL1O94874 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UFL1O94874 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UFL1O94874 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UFL1O94874 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UFL1O94874 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UFL1O94874 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UFL1O94874 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
UFL1O94874 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
UFL1O94874 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
UFL1O94874 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
UFL1O94874 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
UFL1O94874 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
UFL1O94874 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UFL1O94874 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UFL1O94874 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UFL1O94874 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UFL1O94874 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UFL1O94874 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UFL1O94874 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UFL1O94874 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UFL1O94874 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UFL1O94874 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UFL1O94874 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UFL1O94874 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UFL1O94874 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UFL1O94874 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UFL1O94874 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UFL1O94874 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UFL1O94874 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UFL1O94874 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UFL1O94874 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UFL1O94874 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UFL1O94874 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UFL1O94874 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UFL1O94874 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UFL1O94874 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UFL1O94874 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UFL1O94874 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UFL1O94874 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UFL1O94874 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UFL1O94874 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UFL1O94874 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UFL1O94874 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UFL1O94874 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UFL1O94874 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
UFL1O94874 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UFL1O94874 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UFL1O94874 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UFL1O94874 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UFL1O94874 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UFL1O94874 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UFL1O94874 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UFL1O94874 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UFL1O94874 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
UFL1O94874 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UFL1O94874 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UFL1O94874 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UFL1O94874 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UFL1O94874 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UFL1O94874 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
UFL1O94874 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
UFL1O94874 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UFL1O94874 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UFL1O94874 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UFL1O94874 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UFL1O94874 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
UFL1O94874 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UFL1O94874 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UFL1O94874 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UFL1O94874 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UFL1O94874 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UFL1O94874 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UFL1O94874 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UFL1O94874 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UFL1O94874 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
UFL1O94874 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UFL1O94874 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UFL1O94874 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
UFL1O94874 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
UFL1O94874 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
UFL1O94874 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
UFL1O94874 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UFL1O94874 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UFL1O94874 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms