Protein–RNA interactions for Protein: O75712

GJB3, Gap junction beta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB3O75712 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB3O75712 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB3O75712 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB3O75712 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB3O75712 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB3O75712 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB3O75712 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB3O75712 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB3O75712 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB3O75712 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB3O75712 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB3O75712 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB3O75712 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB3O75712 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB3O75712 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB3O75712 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB3O75712 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB3O75712 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB3O75712 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB3O75712 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB3O75712 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB3O75712 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB3O75712 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB3O75712 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB3O75712 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB3O75712 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB3O75712 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB3O75712 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB3O75712 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB3O75712 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB3O75712 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB3O75712 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB3O75712 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB3O75712 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB3O75712 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB3O75712 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB3O75712 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB3O75712 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB3O75712 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB3O75712 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB3O75712 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB3O75712 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB3O75712 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB3O75712 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB3O75712 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB3O75712 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB3O75712 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB3O75712 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB3O75712 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB3O75712 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB3O75712 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB3O75712 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB3O75712 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB3O75712 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB3O75712 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB3O75712 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB3O75712 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GJB3O75712 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GJB3O75712 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GJB3O75712 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GJB3O75712 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GJB3O75712 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GJB3O75712 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB3O75712 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB3O75712 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB3O75712 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB3O75712 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB3O75712 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB3O75712 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB3O75712 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB3O75712 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB3O75712 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB3O75712 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB3O75712 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB3O75712 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB3O75712 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB3O75712 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB3O75712 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB3O75712 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB3O75712 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB3O75712 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB3O75712 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB3O75712 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB3O75712 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB3O75712 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB3O75712 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB3O75712 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB3O75712 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB3O75712 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB3O75712 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB3O75712 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB3O75712 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB3O75712 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB3O75712 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB3O75712 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB3O75712 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB3O75712 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB3O75712 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB3O75712 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB3O75712 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms