Protein–RNA interactions for Protein: O55189

Ambn, Ameloblastin, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbnO55189 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AmbnO55189 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AmbnO55189 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AmbnO55189 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AmbnO55189 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
AmbnO55189 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AmbnO55189 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
AmbnO55189 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AmbnO55189 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AmbnO55189 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AmbnO55189 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AmbnO55189 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AmbnO55189 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AmbnO55189 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AmbnO55189 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AmbnO55189 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AmbnO55189 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AmbnO55189 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AmbnO55189 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AmbnO55189 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AmbnO55189 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AmbnO55189 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AmbnO55189 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AmbnO55189 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AmbnO55189 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AmbnO55189 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AmbnO55189 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AmbnO55189 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AmbnO55189 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AmbnO55189 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AmbnO55189 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AmbnO55189 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AmbnO55189 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AmbnO55189 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AmbnO55189 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AmbnO55189 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AmbnO55189 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AmbnO55189 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AmbnO55189 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AmbnO55189 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AmbnO55189 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AmbnO55189 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AmbnO55189 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AmbnO55189 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AmbnO55189 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AmbnO55189 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AmbnO55189 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AmbnO55189 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AmbnO55189 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AmbnO55189 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AmbnO55189 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AmbnO55189 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AmbnO55189 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AmbnO55189 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AmbnO55189 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
AmbnO55189 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
AmbnO55189 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AmbnO55189 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AmbnO55189 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AmbnO55189 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AmbnO55189 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AmbnO55189 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AmbnO55189 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AmbnO55189 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AmbnO55189 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AmbnO55189 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AmbnO55189 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AmbnO55189 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AmbnO55189 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
AmbnO55189 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AmbnO55189 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AmbnO55189 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AmbnO55189 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AmbnO55189 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AmbnO55189 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AmbnO55189 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AmbnO55189 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AmbnO55189 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AmbnO55189 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AmbnO55189 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AmbnO55189 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AmbnO55189 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
AmbnO55189 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
AmbnO55189 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AmbnO55189 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AmbnO55189 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AmbnO55189 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AmbnO55189 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AmbnO55189 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AmbnO55189 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AmbnO55189 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AmbnO55189 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AmbnO55189 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AmbnO55189 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AmbnO55189 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AmbnO55189 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AmbnO55189 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AmbnO55189 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AmbnO55189 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AmbnO55189 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms