Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms