Protein–RNA interactions for Protein: O14579

COPE, Coatomer subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPEO14579 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPEO14579 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPEO14579 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPEO14579 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPEO14579 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPEO14579 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPEO14579 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPEO14579 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPEO14579 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPEO14579 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPEO14579 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPEO14579 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPEO14579 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPEO14579 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPEO14579 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPEO14579 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPEO14579 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPEO14579 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
COPEO14579 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPEO14579 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPEO14579 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPEO14579 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPEO14579 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
COPEO14579 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPEO14579 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPEO14579 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPEO14579 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPEO14579 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPEO14579 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPEO14579 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPEO14579 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
COPEO14579 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPEO14579 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPEO14579 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPEO14579 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPEO14579 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPEO14579 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPEO14579 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPEO14579 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COPEO14579 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPEO14579 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPEO14579 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPEO14579 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPEO14579 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPEO14579 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPEO14579 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPEO14579 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPEO14579 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPEO14579 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPEO14579 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPEO14579 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPEO14579 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPEO14579 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPEO14579 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
COPEO14579 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPEO14579 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
COPEO14579 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COPEO14579 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COPEO14579 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COPEO14579 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COPEO14579 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPEO14579 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPEO14579 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPEO14579 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPEO14579 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPEO14579 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPEO14579 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPEO14579 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPEO14579 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPEO14579 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPEO14579 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPEO14579 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPEO14579 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPEO14579 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPEO14579 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPEO14579 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPEO14579 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPEO14579 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPEO14579 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPEO14579 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPEO14579 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPEO14579 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPEO14579 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPEO14579 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPEO14579 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPEO14579 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPEO14579 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPEO14579 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPEO14579 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPEO14579 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPEO14579 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
COPEO14579 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPEO14579 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPEO14579 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPEO14579 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPEO14579 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPEO14579 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPEO14579 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPEO14579 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPEO14579 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms