Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNAP23O00161 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms