Protein–RNA interactions for Protein: O00160

MYO1F, Unconventional myosin-If, humanhuman

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1FO00160 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYO1FO00160 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYO1FO00160 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYO1FO00160 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYO1FO00160 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYO1FO00160 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYO1FO00160 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYO1FO00160 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYO1FO00160 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MYO1FO00160 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYO1FO00160 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYO1FO00160 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYO1FO00160 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYO1FO00160 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYO1FO00160 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYO1FO00160 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYO1FO00160 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYO1FO00160 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYO1FO00160 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYO1FO00160 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYO1FO00160 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms