Protein–RNA interactions for Protein: H3BNL8

C6orf229, Uncharacterized protein C6orf229, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf229H3BNL8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C6orf229H3BNL8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C6orf229H3BNL8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
C6orf229H3BNL8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
C6orf229H3BNL8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
C6orf229H3BNL8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C6orf229H3BNL8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C6orf229H3BNL8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C6orf229H3BNL8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C6orf229H3BNL8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C6orf229H3BNL8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C6orf229H3BNL8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C6orf229H3BNL8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C6orf229H3BNL8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
C6orf229H3BNL8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C6orf229H3BNL8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
C6orf229H3BNL8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
C6orf229H3BNL8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C6orf229H3BNL8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C6orf229H3BNL8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
C6orf229H3BNL8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
C6orf229H3BNL8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
C6orf229H3BNL8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
C6orf229H3BNL8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
C6orf229H3BNL8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
C6orf229H3BNL8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
C6orf229H3BNL8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C6orf229H3BNL8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C6orf229H3BNL8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C6orf229H3BNL8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C6orf229H3BNL8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C6orf229H3BNL8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C6orf229H3BNL8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C6orf229H3BNL8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
C6orf229H3BNL8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
C6orf229H3BNL8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
C6orf229H3BNL8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
C6orf229H3BNL8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C6orf229H3BNL8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
C6orf229H3BNL8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C6orf229H3BNL8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C6orf229H3BNL8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
C6orf229H3BNL8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
C6orf229H3BNL8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
C6orf229H3BNL8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
C6orf229H3BNL8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
C6orf229H3BNL8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
C6orf229H3BNL8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C6orf229H3BNL8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C6orf229H3BNL8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C6orf229H3BNL8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C6orf229H3BNL8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C6orf229H3BNL8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C6orf229H3BNL8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C6orf229H3BNL8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C6orf229H3BNL8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C6orf229H3BNL8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C6orf229H3BNL8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C6orf229H3BNL8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C6orf229H3BNL8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C6orf229H3BNL8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
C6orf229H3BNL8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
C6orf229H3BNL8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
C6orf229H3BNL8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
C6orf229H3BNL8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
C6orf229H3BNL8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
C6orf229H3BNL8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
C6orf229H3BNL8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C6orf229H3BNL8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
C6orf229H3BNL8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
C6orf229H3BNL8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
C6orf229H3BNL8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
C6orf229H3BNL8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
C6orf229H3BNL8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
C6orf229H3BNL8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
C6orf229H3BNL8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
C6orf229H3BNL8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
C6orf229H3BNL8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
C6orf229H3BNL8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
C6orf229H3BNL8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
C6orf229H3BNL8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
C6orf229H3BNL8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
C6orf229H3BNL8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C6orf229H3BNL8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C6orf229H3BNL8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C6orf229H3BNL8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
C6orf229H3BNL8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
C6orf229H3BNL8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
C6orf229H3BNL8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
C6orf229H3BNL8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
C6orf229H3BNL8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
C6orf229H3BNL8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C6orf229H3BNL8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C6orf229H3BNL8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
C6orf229H3BNL8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
C6orf229H3BNL8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
C6orf229H3BNL8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
C6orf229H3BNL8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
C6orf229H3BNL8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
C6orf229H3BNL8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms