Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NEDD8-MDP1E9PL57 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEDD8-MDP1E9PL57 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEDD8-MDP1E9PL57 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEDD8-MDP1E9PL57 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEDD8-MDP1E9PL57 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEDD8-MDP1E9PL57 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NEDD8-MDP1E9PL57 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NEDD8-MDP1E9PL57 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEDD8-MDP1E9PL57 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEDD8-MDP1E9PL57 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEDD8-MDP1E9PL57 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEDD8-MDP1E9PL57 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEDD8-MDP1E9PL57 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEDD8-MDP1E9PL57 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEDD8-MDP1E9PL57 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEDD8-MDP1E9PL57 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEDD8-MDP1E9PL57 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEDD8-MDP1E9PL57 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEDD8-MDP1E9PL57 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEDD8-MDP1E9PL57 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEDD8-MDP1E9PL57 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD8-MDP1E9PL57 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD8-MDP1E9PL57 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD8-MDP1E9PL57 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD8-MDP1E9PL57 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD8-MDP1E9PL57 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD8-MDP1E9PL57 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD8-MDP1E9PL57 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD8-MDP1E9PL57 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD8-MDP1E9PL57 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD8-MDP1E9PL57 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD8-MDP1E9PL57 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD8-MDP1E9PL57 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NEDD8-MDP1E9PL57 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1E9PL57 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1E9PL57 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1E9PL57 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1E9PL57 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1E9PL57 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1E9PL57 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1E9PL57 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1E9PL57 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1E9PL57 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1E9PL57 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1E9PL57 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1E9PL57 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1E9PL57 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1E9PL57 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1E9PL57 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1E9PL57 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1E9PL57 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1E9PL57 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1E9PL57 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1E9PL57 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1E9PL57 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1E9PL57 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1E9PL57 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1E9PL57 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1E9PL57 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1E9PL57 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1E9PL57 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1E9PL57 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1E9PL57 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1E9PL57 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1E9PL57 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1E9PL57 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1E9PL57 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1E9PL57 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1E9PL57 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1E9PL57 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1E9PL57 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1E9PL57 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1E9PL57 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1E9PL57 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1E9PL57 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1E9PL57 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1E9PL57 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms