Protein–RNA interactions for Protein: A6NIE6

RRN3P2, Putative RRN3-like protein RRN3P2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P2A6NIE6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRN3P2A6NIE6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRN3P2A6NIE6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRN3P2A6NIE6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RRN3P2A6NIE6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms