Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 GLDC-216ENST00000639639 1559 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 SETDB1-202ENST00000368962 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 ALDH3B2-204ENST00000530069 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 TAGLN2-201ENST00000320307 709 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 RNA5SP407-201ENST00000410275 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 RN7SKP102-201ENST00000411186 315 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 AC006967.2-201ENST00000426169 432 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 HLA-DRB6-202ENST00000437183 1090 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 PRDX3P2-201ENST00000447051 611 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 LAMTOR5-203ENST00000474861 1154 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 AC098591.1-202ENST00000507914 937 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 DIS3L2P1-201ENST00000509197 559 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 TSHZ3-202ENST00000558569 441 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 BMS1P8-203ENST00000567036 614 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 MIR4688-201ENST00000577966 83 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 AC010319.4-201ENST00000593957 691 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 AC104521.1-201ENST00000598582 279 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 DUSP22-206ENST00000603453 804 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 AC097634.2-201ENST00000615819 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 AC020763.2-201ENST00000623155 1255 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 LUC7L3-223ENST00000625349 408 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 AC068987.3-201ENST00000637934 1195 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 PAX6-255ENST00000639386 1723 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 DRD3-204ENST00000467632 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 FAM95B1-211ENST00000592053 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 AL669942.1-203ENST00000610972 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 MLPH-202ENST00000338530 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 CACNA2D4-209ENST00000538450 1498 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 SERPINA1-220ENST00000636712 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 MED27-201ENST00000292035 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 ACER1-201ENST00000301452 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 EPS8L3-201ENST00000361852 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 ZNF684-203ENST00000372699 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 TBC1D21-201ENST00000300504 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 OR52N1-201ENST00000317078 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 CD3G-202ENST00000392883 1179 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 NANOS3-202ENST00000397555 769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 MIR1226-201ENST00000408658 75 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 AL583804.1-201ENST00000448643 810 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 SMCR2-201ENST00000456090 564 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 HAX1-204ENST00000457918 914 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 ST3GAL1P1-201ENST00000513810 1014 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 AC100797.1-201ENST00000520760 316 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 AC011603.2-201ENST00000548149 675 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 SNHG21-205ENST00000561107 790 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 AC103706.1-201ENST00000561761 679 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 AC007223.1-201ENST00000564076 572 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 AC104440.1-201ENST00000605010 343 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 LINC02348-201ENST00000618724 489 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 LINC00963-217ENST00000624009 663 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 LINC00959-202ENST00000637128 826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 SERPINA1-205ENST00000404814 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 CPPED1-203ENST00000433677 1993 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 ZDHHC4-202ENST00000396706 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 NPL-205ENST00000367555 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 LILRB1-202ENST00000396315 2157 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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