Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 ZCRB1-201ENST00000266529 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 ZFYVE19-209ENST00000564258 2059 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 ANKRD20A7P-201ENST00000402318 2414 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 SFTPA1-203ENST00000428376 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 ATP6V0D1-218ENST00000602876 1554 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 CCDC163-203ENST00000626657 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 FAM213AP2-201ENST00000521579 683 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 AIPL1-210ENST00000576307 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 STT3A-211ENST00000529196 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 ZFHX4-AS1-201ENST00000518143 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 MGLL-202ENST00000398101 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 CCDC159-209ENST00000588790 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 CCDC3-202ENST00000378839 3180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 LINC02228-202ENST00000641261 2489 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 PECR-201ENST00000265322 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 SOX30-203ENST00000519442 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 OR2V2-201ENST00000328275 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 RN7SKP255-201ENST00000363442 313 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 RN7SKP203-201ENST00000363618 332 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 RN7SKP71-201ENST00000364558 318 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 7SK.1-201ENST00000365328 331 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 MPPE1-204ENST00000344987 1831 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.2 ms