Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 MLX-203ENST00000435881 2428 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 MAX-212ENST00000555932 1673 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 PBX1-203ENST00000420696 6636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 CAMKK2-205ENST00000392474 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AL356130.1-201ENST00000620188 1965 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 MPP4-203ENST00000396886 2250 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 ITGAL-201ENST00000356798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 LINC01209-201ENST00000451289 2400 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 MAN2B2-201ENST00000285599 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 ATG7-213ENST00000446450 2042 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AC092028.1-202ENST00000641483 3547 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AC092028.1-201ENST00000641781 3540 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 TRIM21-201ENST00000254436 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 PAX2-203ENST00000370296 4140 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 FSTL1-202ENST00000424703 1396 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 PAX2-205ENST00000428433 4126 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 PPP4R3B-203ENST00000611717 5243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 UGT1A10-202ENST00000373445 2065 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 DNMT3B-203ENST00000348286 4048 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 DBF4B-202ENST00000393547 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AL359979.2-201ENST00000435108 613 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 CYP11B1-203ENST00000377675 2280 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 MYLK-204ENST00000360304 7738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AL449403.1-201ENST00000432783 1577 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AC068580.3-201ENST00000449248 2015 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 DUSP11-202ENST00000443070 2175 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 IKZF1-211ENST00000440768 5511 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 NRXN1-233ENST00000630543 4500 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 ZNF706-209ENST00000520347 3502 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 HIVEP2-203ENST00000367604 10032 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AC024560.1-201ENST00000424493 1471 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms