Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLD1P28340 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLD1P28340 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLD1P28340 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLD1P28340 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLD1P28340 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLD1P28340 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLD1P28340 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLD1P28340 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLD1P28340 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLD1P28340 ZNF582-201ENST00000301310 2824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLD1P28340 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD1P28340 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD1P28340 TPI1P3-201ENST00000335020 740 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD1P28340 OOEP-201ENST00000370359 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD1P28340 LCN12-202ENST00000371633 579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD1P28340 MIR1249-201ENST00000408671 66 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD1P28340 OR2A14-201ENST00000408899 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD1P28340 MLN-202ENST00000430124 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD1P28340 NR1I3-210ENST00000437437 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD1P28340 AL357140.1-201ENST00000454104 424 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD1P28340 HINT1-204ENST00000506908 681 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD1P28340 KRTAP2-2-202ENST00000542910 390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD1P28340 CACNA1C-AS1-203ENST00000544517 742 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD1P28340 EGLN3-209ENST00000553215 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD1P28340 AC018868.2-201ENST00000559655 1259 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD1P28340 AC025682.1-203ENST00000584391 442 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD1P28340 AC005336.1-201ENST00000585431 1243 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD1P28340 AC021594.2-201ENST00000592499 527 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD1P28340 CYP2B7P-202ENST00000593298 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD1P28340 AC020909.3-201ENST00000598194 375 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD1P28340 MIR1914-201ENST00000607800 80 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD1P28340 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD1P28340 LILRA5-201ENST00000432233 1363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD1P28340 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD1P28340 IKZF3-211ENST00000394189 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD1P28340 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD1P28340 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD1P28340 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD1P28340 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD1P28340 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD1P28340 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD1P28340 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD1P28340 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD1P28340 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD1P28340 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD1P28340 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD1P28340 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD1P28340 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD1P28340 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD1P28340 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD1P28340 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLD1P28340 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLD1P28340 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLD1P28340 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLD1P28340 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLD1P28340 MEG3-214ENST00000519709 1726 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLD1P28340 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLD1P28340 VOPP1-206ENST00000428097 1671 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLD1P28340 GBAP1-208ENST00000566701 1546 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
POLD1P28340 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLD1P28340 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLD1P28340 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLD1P28340 TPD52L3-203ENST00000381428 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLD1P28340 OR2T34-201ENST00000328782 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLD1P28340 OR2T3-201ENST00000359594 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLD1P28340 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLD1P28340 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLD1P28340 TRIM15-206ENST00000376688 426 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLD1P28340 CD74-203ENST00000377795 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLD1P28340 LDHAL6FP-201ENST00000405916 1082 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
POLD1P28340 FAM138A-201ENST00000417324 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLD1P28340 AC006967.2-201ENST00000426169 432 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLD1P28340 HLA-DRB6-202ENST00000437183 1090 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
POLD1P28340 AL391822.1-201ENST00000452580 562 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
POLD1P28340 FAM138D-201ENST00000504074 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLD1P28340 AC110753.1-201ENST00000505711 1022 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
POLD1P28340 FAM138E-201ENST00000507796 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLD1P28340 ALG1L14P-201ENST00000514230 434 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
POLD1P28340 IFI27L1-209ENST00000555523 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLD1P28340 KRT16P1-202ENST00000577750 679 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLD1P28340 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLD1P28340 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLD1P28340 AD000091.1-201ENST00000592379 287 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
POLD1P28340 AC010531.7-201ENST00000602665 465 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLD1P28340 AL512631.1-201ENST00000604086 840 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
POLD1P28340 MAP3K14-205ENST00000617331 1049 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLD1P28340 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLD1P28340 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLD1P28340 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLD1P28340 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
POLD1P28340 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLD1P28340 C1QTNF3-201ENST00000231338 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLD1P28340 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLD1P28340 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLD1P28340 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLD1P28340 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLD1P28340 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLD1P28340 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLD1P28340 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms