Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 FAM25E-201ENST00000411791 322 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 AL606970.2-201ENST00000434596 470 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 AC097658.2-201ENST00000512715 624 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 AC103706.1-201ENST00000561761 679 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 PDZRN3-AS1-202ENST00000608304 774 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 RN7SL341P-201ENST00000613745 298 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 IP6K2-201ENST00000328631 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 AC073862.3-201ENST00000624597 1648 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 KLHDC2-211ENST00000557247 1565 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 SDR16C5-203ENST00000522671 1988 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 PITPNB-201ENST00000320996 2826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 CACNB4-201ENST00000201943 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 AZGP1-201ENST00000292401 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 SLURP1-201ENST00000246515 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 AL512328.1-203ENST00000428480 673 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 RRNAD1-204ENST00000476229 1096 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 HINT1-204ENST00000506908 681 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 AC127496.5-202ENST00000572036 869 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 ZG16B-204ENST00000572863 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 AC005154.1-227ENST00000579174 755 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 RN7SL5P-201ENST00000581458 321 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 RN7SL827P-201ENST00000607480 288 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 AL133551.1-201ENST00000610279 1222 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 MIR6819-201ENST00000622122 61 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 RBM22P2-201ENST00000393978 1814 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 TTC26-207ENST00000478836 1794 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 SGCE-201ENST00000265735 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 M1AP-201ENST00000290536 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 AC099689.1-201ENST00000624383 1302 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 FXYD2-201ENST00000260287 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 GSTK1-201ENST00000358406 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 SNAP25-AS1-202ENST00000426491 804 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 AC008750.5-201ENST00000595500 473 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 FXYD3-212ENST00000605550 590 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 CDCA7L-202ENST00000373934 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 FAM9A-201ENST00000381003 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 ERGIC3-202ENST00000348547 1359 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 SARS2-205ENST00000594171 1631 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 AC007312.1-201ENST00000427493 258 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 TAC3-209ENST00000458521 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 GINS4-203ENST00000518671 1158 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 CNOT8-217ENST00000521450 1158 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 AC009646.2-202ENST00000524425 826 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 NPLOC4-214ENST00000573876 560 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 DUSP22-206ENST00000603453 804 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 C12orf45-205ENST00000622317 1078 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 PPP1R11-204ENST00000376769 1689 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 PCTP-202ENST00000325214 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 AC005154.3-201ENST00000419639 1393 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 KRT40-202ENST00000398486 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 CYP20A1-210ENST00000613925 1986 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
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