Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC083873.1-201ENST00000421179 1099 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 AC008267.3-201ENST00000448776 712 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 PSMB8-AS1-206ENST00000458296 958 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 PIEZO1P1-201ENST00000485427 219 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 CHCHD10-204ENST00000520222 384 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 HNRNPA1P72-201ENST00000529511 967 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 AC027228.1-201ENST00000560094 325 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 Z92544.2-202ENST00000566927 407 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 INCA1-202ENST00000574617 1260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 ALOX12P1-201ENST00000579299 1229 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 AC100778.4-201ENST00000581232 582 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 SNHG5-211ENST00000587692 1029 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 AC010319.2-201ENST00000594663 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 AC090950.1-202ENST00000605733 644 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 AL353581.1-201ENST00000606916 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 PILRB-213ENST00000609309 993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 LUC7L3-223ENST00000625349 408 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 AL590428.1-201ENST00000428865 1973 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 GIMAP4-202ENST00000461940 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 TACC1-209ENST00000520611 1550 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 BX005132.1-201ENST00000641403 1580 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
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TCOF1Q13428 CREB5-203ENST00000396299 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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TCOF1Q13428 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 TREH-202ENST00000397925 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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TCOF1Q13428 ZNRD1-204ENST00000376785 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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TCOF1Q13428 RPL26-209ENST00000584164 873 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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TCOF1Q13428 IFI27-214ENST00000620396 599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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TCOF1Q13428 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 LILRA2-204ENST00000391738 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 FAM156A-203ENST00000611661 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 ANKRA2-201ENST00000296785 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 DHRS12-202ENST00000280056 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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TCOF1Q13428 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 EDF1-201ENST00000224073 640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 ANAPC15-201ENST00000227618 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 C16orf78-201ENST00000299191 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 AC064853.1-201ENST00000413096 540 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 HNRNPA1P59-201ENST00000430583 918 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 RN7SL638P-201ENST00000494527 290 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 SMUG1-213ENST00000506595 712 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 RN7SKP195-201ENST00000516587 303 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 AC091691.1-201ENST00000583587 1018 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 LINC00959-202ENST00000637128 826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 RUSC1-AS1-202ENST00000446880 1836 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 AZGP1-201ENST00000292401 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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