Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NOD1Q9Y239 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NOD1Q9Y239 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NOD1Q9Y239 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NOD1Q9Y239 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NOD1Q9Y239 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NOD1Q9Y239 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NOD1Q9Y239 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NOD1Q9Y239 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NOD1Q9Y239 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NOD1Q9Y239 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms