Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDAC9Q9UKV0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDAC9Q9UKV0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDAC9Q9UKV0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDAC9Q9UKV0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDAC9Q9UKV0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDAC9Q9UKV0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDAC9Q9UKV0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDAC9Q9UKV0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDAC9Q9UKV0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDAC9Q9UKV0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDAC9Q9UKV0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDAC9Q9UKV0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDAC9Q9UKV0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDAC9Q9UKV0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDAC9Q9UKV0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDAC9Q9UKV0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDAC9Q9UKV0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDAC9Q9UKV0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDAC9Q9UKV0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDAC9Q9UKV0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDAC9Q9UKV0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDAC9Q9UKV0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDAC9Q9UKV0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDAC9Q9UKV0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDAC9Q9UKV0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDAC9Q9UKV0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDAC9Q9UKV0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDAC9Q9UKV0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDAC9Q9UKV0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDAC9Q9UKV0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDAC9Q9UKV0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDAC9Q9UKV0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDAC9Q9UKV0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms