Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DCTN4Q9UJW0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms