Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCP2D1Q9UJQ7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms