Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP36Q9P275 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms