Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U3

SENP1, Sentrin-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1Q9P0U3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms