Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EHD3Q9NZN3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms