Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZG7

NINJ2, Ninjurin-2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINJ2Q9NZG7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NINJ2Q9NZG7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NINJ2Q9NZG7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms