Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms