Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TOR4AQ9NXH8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TOR4AQ9NXH8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TOR4AQ9NXH8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TOR4AQ9NXH8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TOR4AQ9NXH8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TOR4AQ9NXH8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TOR4AQ9NXH8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TOR4AQ9NXH8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TOR4AQ9NXH8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TOR4AQ9NXH8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TOR4AQ9NXH8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TOR4AQ9NXH8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TOR4AQ9NXH8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TOR4AQ9NXH8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TOR4AQ9NXH8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TOR4AQ9NXH8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TOR4AQ9NXH8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TOR4AQ9NXH8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TOR4AQ9NXH8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TOR4AQ9NXH8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TOR4AQ9NXH8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TOR4AQ9NXH8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TOR4AQ9NXH8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TOR4AQ9NXH8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TOR4AQ9NXH8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TOR4AQ9NXH8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TOR4AQ9NXH8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TOR4AQ9NXH8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TOR4AQ9NXH8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TOR4AQ9NXH8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TOR4AQ9NXH8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TOR4AQ9NXH8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TOR4AQ9NXH8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TOR4AQ9NXH8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TOR4AQ9NXH8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TOR4AQ9NXH8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TOR4AQ9NXH8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TOR4AQ9NXH8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TOR4AQ9NXH8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TOR4AQ9NXH8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TOR4AQ9NXH8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TOR4AQ9NXH8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TOR4AQ9NXH8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TOR4AQ9NXH8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TOR4AQ9NXH8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TOR4AQ9NXH8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TOR4AQ9NXH8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TOR4AQ9NXH8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TOR4AQ9NXH8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TOR4AQ9NXH8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TOR4AQ9NXH8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TOR4AQ9NXH8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TOR4AQ9NXH8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TOR4AQ9NXH8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TOR4AQ9NXH8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TOR4AQ9NXH8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TOR4AQ9NXH8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TOR4AQ9NXH8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TOR4AQ9NXH8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TOR4AQ9NXH8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TOR4AQ9NXH8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TOR4AQ9NXH8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TOR4AQ9NXH8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TOR4AQ9NXH8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TOR4AQ9NXH8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TOR4AQ9NXH8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TOR4AQ9NXH8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TOR4AQ9NXH8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOR4AQ9NXH8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOR4AQ9NXH8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOR4AQ9NXH8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOR4AQ9NXH8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOR4AQ9NXH8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOR4AQ9NXH8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOR4AQ9NXH8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOR4AQ9NXH8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOR4AQ9NXH8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOR4AQ9NXH8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOR4AQ9NXH8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOR4AQ9NXH8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOR4AQ9NXH8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOR4AQ9NXH8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOR4AQ9NXH8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOR4AQ9NXH8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOR4AQ9NXH8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOR4AQ9NXH8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOR4AQ9NXH8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOR4AQ9NXH8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOR4AQ9NXH8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOR4AQ9NXH8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOR4AQ9NXH8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOR4AQ9NXH8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOR4AQ9NXH8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOR4AQ9NXH8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOR4AQ9NXH8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOR4AQ9NXH8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOR4AQ9NXH8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOR4AQ9NXH8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TOR4AQ9NXH8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms