Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXB0

MKS1, Meckel syndrome type 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1Q9NXB0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MKS1Q9NXB0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKS1Q9NXB0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKS1Q9NXB0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MKS1Q9NXB0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MKS1Q9NXB0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKS1Q9NXB0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKS1Q9NXB0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms