Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DUOX1Q9NRD9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
DUOX1Q9NRD9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
DUOX1Q9NRD9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DUOX1Q9NRD9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DUOX1Q9NRD9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DUOX1Q9NRD9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
DUOX1Q9NRD9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DUOX1Q9NRD9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
DUOX1Q9NRD9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DUOX1Q9NRD9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DUOX1Q9NRD9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DUOX1Q9NRD9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DUOX1Q9NRD9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DUOX1Q9NRD9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DUOX1Q9NRD9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DUOX1Q9NRD9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DUOX1Q9NRD9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.7 ms