Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
TNRC6CQ9HCJ0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms