Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBA0

TRPV4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV4Q9HBA0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TRPV4Q9HBA0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRPV4Q9HBA0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRPV4Q9HBA0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRPV4Q9HBA0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRPV4Q9HBA0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRPV4Q9HBA0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRPV4Q9HBA0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRPV4Q9HBA0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms