Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
SYCP2Q9BX26 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SYCP2Q9BX26 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
SYCP2Q9BX26 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SYCP2Q9BX26 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SYCP2Q9BX26 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SYCP2Q9BX26 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SYCP2Q9BX26 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SYCP2Q9BX26 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SYCP2Q9BX26 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SYCP2Q9BX26 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SYCP2Q9BX26 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
SYCP2Q9BX26 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SYCP2Q9BX26 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SYCP2Q9BX26 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SYCP2Q9BX26 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SYCP2Q9BX26 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SYCP2Q9BX26 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SYCP2Q9BX26 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SYCP2Q9BX26 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SYCP2Q9BX26 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SYCP2Q9BX26 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SYCP2Q9BX26 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SYCP2Q9BX26 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SYCP2Q9BX26 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SYCP2Q9BX26 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SYCP2Q9BX26 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SYCP2Q9BX26 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SYCP2Q9BX26 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SYCP2Q9BX26 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SYCP2Q9BX26 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SYCP2Q9BX26 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
SYCP2Q9BX26 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SYCP2Q9BX26 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SYCP2Q9BX26 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SYCP2Q9BX26 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
SYCP2Q9BX26 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SYCP2Q9BX26 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SYCP2Q9BX26 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SYCP2Q9BX26 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SYCP2Q9BX26 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SYCP2Q9BX26 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SYCP2Q9BX26 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SYCP2Q9BX26 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SYCP2Q9BX26 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SYCP2Q9BX26 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SYCP2Q9BX26 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SYCP2Q9BX26 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SYCP2Q9BX26 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SYCP2Q9BX26 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SYCP2Q9BX26 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SYCP2Q9BX26 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SYCP2Q9BX26 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SYCP2Q9BX26 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SYCP2Q9BX26 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SYCP2Q9BX26 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SYCP2Q9BX26 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SYCP2Q9BX26 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SYCP2Q9BX26 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SYCP2Q9BX26 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
SYCP2Q9BX26 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
SYCP2Q9BX26 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SYCP2Q9BX26 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SYCP2Q9BX26 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
SYCP2Q9BX26 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
SYCP2Q9BX26 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
SYCP2Q9BX26 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
SYCP2Q9BX26 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SYCP2Q9BX26 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SYCP2Q9BX26 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SYCP2Q9BX26 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SYCP2Q9BX26 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC33.8■■■■□ 3
SYCP2Q9BX26 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
SYCP2Q9BX26 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SYCP2Q9BX26 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SYCP2Q9BX26 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SYCP2Q9BX26 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
SYCP2Q9BX26 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
SYCP2Q9BX26 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
SYCP2Q9BX26 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
SYCP2Q9BX26 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SYCP2Q9BX26 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SYCP2Q9BX26 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
SYCP2Q9BX26 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC33.78■■■■□ 3
SYCP2Q9BX26 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
SYCP2Q9BX26 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
SYCP2Q9BX26 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SYCP2Q9BX26 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
SYCP2Q9BX26 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SYCP2Q9BX26 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SYCP2Q9BX26 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SYCP2Q9BX26 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
SYCP2Q9BX26 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SYCP2Q9BX26 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SYCP2Q9BX26 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
SYCP2Q9BX26 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
SYCP2Q9BX26 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC33.76■■■■□ 3
SYCP2Q9BX26 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
SYCP2Q9BX26 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC33.76■■■■□ 3
SYCP2Q9BX26 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC33.76■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms