Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms