Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
NOTCH4Q99466 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NOTCH4Q99466 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms