Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NLRP3Q96P20 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NLRP3Q96P20 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NLRP3Q96P20 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NLRP3Q96P20 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NLRP3Q96P20 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NLRP3Q96P20 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NLRP3Q96P20 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NLRP3Q96P20 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NLRP3Q96P20 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NLRP3Q96P20 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NLRP3Q96P20 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NLRP3Q96P20 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NLRP3Q96P20 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NLRP3Q96P20 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NLRP3Q96P20 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NLRP3Q96P20 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NLRP3Q96P20 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NLRP3Q96P20 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NLRP3Q96P20 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NLRP3Q96P20 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRP3Q96P20 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRP3Q96P20 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRP3Q96P20 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRP3Q96P20 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRP3Q96P20 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRP3Q96P20 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRP3Q96P20 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP3Q96P20 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP3Q96P20 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP3Q96P20 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP3Q96P20 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP3Q96P20 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP3Q96P20 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP3Q96P20 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms