Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC115Q96NT0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC115Q96NT0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms