Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX27Q96L92 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNX27Q96L92 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX27Q96L92 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX27Q96L92 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX27Q96L92 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX27Q96L92 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX27Q96L92 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX27Q96L92 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX27Q96L92 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX27Q96L92 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX27Q96L92 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX27Q96L92 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX27Q96L92 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX27Q96L92 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX27Q96L92 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX27Q96L92 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX27Q96L92 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX27Q96L92 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX27Q96L92 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX27Q96L92 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX27Q96L92 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX27Q96L92 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX27Q96L92 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX27Q96L92 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX27Q96L92 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX27Q96L92 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX27Q96L92 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX27Q96L92 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX27Q96L92 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX27Q96L92 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX27Q96L92 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX27Q96L92 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX27Q96L92 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX27Q96L92 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX27Q96L92 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX27Q96L92 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX27Q96L92 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX27Q96L92 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX27Q96L92 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX27Q96L92 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX27Q96L92 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX27Q96L92 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX27Q96L92 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX27Q96L92 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX27Q96L92 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX27Q96L92 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX27Q96L92 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX27Q96L92 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX27Q96L92 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX27Q96L92 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX27Q96L92 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX27Q96L92 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX27Q96L92 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX27Q96L92 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX27Q96L92 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms