Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
COG3Q96JB2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
COG3Q96JB2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
COG3Q96JB2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
COG3Q96JB2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
COG3Q96JB2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
COG3Q96JB2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
COG3Q96JB2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
COG3Q96JB2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
COG3Q96JB2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
COG3Q96JB2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
COG3Q96JB2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
COG3Q96JB2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
COG3Q96JB2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
COG3Q96JB2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
COG3Q96JB2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
COG3Q96JB2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
COG3Q96JB2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
COG3Q96JB2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
COG3Q96JB2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
COG3Q96JB2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
COG3Q96JB2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
COG3Q96JB2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
COG3Q96JB2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
COG3Q96JB2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
COG3Q96JB2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
COG3Q96JB2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
COG3Q96JB2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
COG3Q96JB2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
COG3Q96JB2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
COG3Q96JB2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
COG3Q96JB2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
COG3Q96JB2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
COG3Q96JB2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
COG3Q96JB2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
COG3Q96JB2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
COG3Q96JB2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
COG3Q96JB2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
COG3Q96JB2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
COG3Q96JB2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms