Protein–RNA interactions for Protein: Q96GN5

CDCA7L, Cell division cycle-associated 7-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA7LQ96GN5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDCA7LQ96GN5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDCA7LQ96GN5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDCA7LQ96GN5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDCA7LQ96GN5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDCA7LQ96GN5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDCA7LQ96GN5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CDCA7LQ96GN5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDCA7LQ96GN5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDCA7LQ96GN5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDCA7LQ96GN5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDCA7LQ96GN5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDCA7LQ96GN5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDCA7LQ96GN5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDCA7LQ96GN5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDCA7LQ96GN5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDCA7LQ96GN5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDCA7LQ96GN5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDCA7LQ96GN5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CDCA7LQ96GN5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDCA7LQ96GN5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDCA7LQ96GN5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDCA7LQ96GN5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CDCA7LQ96GN5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDCA7LQ96GN5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDCA7LQ96GN5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CDCA7LQ96GN5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDCA7LQ96GN5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDCA7LQ96GN5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDCA7LQ96GN5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDCA7LQ96GN5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDCA7LQ96GN5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDCA7LQ96GN5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDCA7LQ96GN5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDCA7LQ96GN5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDCA7LQ96GN5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDCA7LQ96GN5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDCA7LQ96GN5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDCA7LQ96GN5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDCA7LQ96GN5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms