Protein–RNA interactions for Protein: Q96G21

IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4Q96G21 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms