Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT7

ASIC4, Acid-sensing ion channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC4Q96FT7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ASIC4Q96FT7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ASIC4Q96FT7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ASIC4Q96FT7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ASIC4Q96FT7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASIC4Q96FT7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ASIC4Q96FT7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASIC4Q96FT7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASIC4Q96FT7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASIC4Q96FT7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASIC4Q96FT7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASIC4Q96FT7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASIC4Q96FT7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASIC4Q96FT7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ASIC4Q96FT7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ASIC4Q96FT7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASIC4Q96FT7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASIC4Q96FT7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASIC4Q96FT7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASIC4Q96FT7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASIC4Q96FT7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ASIC4Q96FT7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASIC4Q96FT7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ASIC4Q96FT7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASIC4Q96FT7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASIC4Q96FT7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASIC4Q96FT7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASIC4Q96FT7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASIC4Q96FT7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASIC4Q96FT7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASIC4Q96FT7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASIC4Q96FT7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASIC4Q96FT7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASIC4Q96FT7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASIC4Q96FT7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASIC4Q96FT7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASIC4Q96FT7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ASIC4Q96FT7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASIC4Q96FT7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASIC4Q96FT7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASIC4Q96FT7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASIC4Q96FT7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ASIC4Q96FT7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ASIC4Q96FT7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ASIC4Q96FT7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ASIC4Q96FT7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ASIC4Q96FT7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ASIC4Q96FT7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ASIC4Q96FT7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ASIC4Q96FT7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ASIC4Q96FT7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ASIC4Q96FT7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ASIC4Q96FT7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ASIC4Q96FT7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ASIC4Q96FT7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ASIC4Q96FT7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ASIC4Q96FT7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ASIC4Q96FT7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ASIC4Q96FT7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ASIC4Q96FT7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ASIC4Q96FT7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ASIC4Q96FT7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ASIC4Q96FT7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ASIC4Q96FT7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ASIC4Q96FT7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ASIC4Q96FT7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ASIC4Q96FT7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ASIC4Q96FT7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ASIC4Q96FT7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ASIC4Q96FT7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ASIC4Q96FT7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ASIC4Q96FT7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ASIC4Q96FT7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ASIC4Q96FT7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ASIC4Q96FT7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ASIC4Q96FT7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ASIC4Q96FT7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ASIC4Q96FT7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ASIC4Q96FT7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ASIC4Q96FT7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ASIC4Q96FT7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ASIC4Q96FT7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ASIC4Q96FT7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ASIC4Q96FT7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ASIC4Q96FT7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ASIC4Q96FT7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ASIC4Q96FT7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ASIC4Q96FT7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ASIC4Q96FT7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ASIC4Q96FT7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ASIC4Q96FT7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ASIC4Q96FT7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ASIC4Q96FT7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ASIC4Q96FT7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ASIC4Q96FT7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ASIC4Q96FT7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ASIC4Q96FT7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ASIC4Q96FT7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ASIC4Q96FT7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ASIC4Q96FT7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms