Protein–RNA interactions for Protein: Q96D15

RCN3, Reticulocalbin-3, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN3Q96D15 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RCN3Q96D15 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RCN3Q96D15 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RCN3Q96D15 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
RCN3Q96D15 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RCN3Q96D15 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RCN3Q96D15 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RCN3Q96D15 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RCN3Q96D15 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RCN3Q96D15 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RCN3Q96D15 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RCN3Q96D15 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RCN3Q96D15 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RCN3Q96D15 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RCN3Q96D15 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RCN3Q96D15 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RCN3Q96D15 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RCN3Q96D15 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RCN3Q96D15 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RCN3Q96D15 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RCN3Q96D15 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
RCN3Q96D15 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RCN3Q96D15 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RCN3Q96D15 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RCN3Q96D15 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RCN3Q96D15 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RCN3Q96D15 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RCN3Q96D15 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RCN3Q96D15 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RCN3Q96D15 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RCN3Q96D15 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RCN3Q96D15 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RCN3Q96D15 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RCN3Q96D15 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RCN3Q96D15 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RCN3Q96D15 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RCN3Q96D15 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RCN3Q96D15 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RCN3Q96D15 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
RCN3Q96D15 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RCN3Q96D15 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RCN3Q96D15 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RCN3Q96D15 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RCN3Q96D15 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RCN3Q96D15 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RCN3Q96D15 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RCN3Q96D15 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RCN3Q96D15 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RCN3Q96D15 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RCN3Q96D15 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RCN3Q96D15 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RCN3Q96D15 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RCN3Q96D15 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RCN3Q96D15 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RCN3Q96D15 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RCN3Q96D15 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RCN3Q96D15 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RCN3Q96D15 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RCN3Q96D15 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RCN3Q96D15 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RCN3Q96D15 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RCN3Q96D15 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RCN3Q96D15 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RCN3Q96D15 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RCN3Q96D15 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RCN3Q96D15 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms