Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms