Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms