Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
IGSF1Q8N6C5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
IGSF1Q8N6C5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
IGSF1Q8N6C5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IGSF1Q8N6C5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
IGSF1Q8N6C5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
IGSF1Q8N6C5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
IGSF1Q8N6C5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
IGSF1Q8N6C5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
IGSF1Q8N6C5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IGSF1Q8N6C5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IGSF1Q8N6C5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IGSF1Q8N6C5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IGSF1Q8N6C5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
IGSF1Q8N6C5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
IGSF1Q8N6C5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
IGSF1Q8N6C5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
IGSF1Q8N6C5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
IGSF1Q8N6C5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
IGSF1Q8N6C5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IGSF1Q8N6C5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IGSF1Q8N6C5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
IGSF1Q8N6C5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IGSF1Q8N6C5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
IGSF1Q8N6C5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
IGSF1Q8N6C5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
IGSF1Q8N6C5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IGSF1Q8N6C5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
IGSF1Q8N6C5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
IGSF1Q8N6C5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
IGSF1Q8N6C5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
IGSF1Q8N6C5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
IGSF1Q8N6C5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IGSF1Q8N6C5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
IGSF1Q8N6C5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IGSF1Q8N6C5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
IGSF1Q8N6C5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IGSF1Q8N6C5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
IGSF1Q8N6C5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
IGSF1Q8N6C5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IGSF1Q8N6C5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IGSF1Q8N6C5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IGSF1Q8N6C5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
IGSF1Q8N6C5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
IGSF1Q8N6C5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IGSF1Q8N6C5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
IGSF1Q8N6C5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IGSF1Q8N6C5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
IGSF1Q8N6C5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
IGSF1Q8N6C5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
IGSF1Q8N6C5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
IGSF1Q8N6C5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
IGSF1Q8N6C5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms