Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HERC6Q8IVU3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HERC6Q8IVU3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms