Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
STRCQ7RTU9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
STRCQ7RTU9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
STRCQ7RTU9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
STRCQ7RTU9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
STRCQ7RTU9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
STRCQ7RTU9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
STRCQ7RTU9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
STRCQ7RTU9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
STRCQ7RTU9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
STRCQ7RTU9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
STRCQ7RTU9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
STRCQ7RTU9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
STRCQ7RTU9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
STRCQ7RTU9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
STRCQ7RTU9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
STRCQ7RTU9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
STRCQ7RTU9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
STRCQ7RTU9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
STRCQ7RTU9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
STRCQ7RTU9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
STRCQ7RTU9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
STRCQ7RTU9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
STRCQ7RTU9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
STRCQ7RTU9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
STRCQ7RTU9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
STRCQ7RTU9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
STRCQ7RTU9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
STRCQ7RTU9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
STRCQ7RTU9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
STRCQ7RTU9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
STRCQ7RTU9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
STRCQ7RTU9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
STRCQ7RTU9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
STRCQ7RTU9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
STRCQ7RTU9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
STRCQ7RTU9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
STRCQ7RTU9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
STRCQ7RTU9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
STRCQ7RTU9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
STRCQ7RTU9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
STRCQ7RTU9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
STRCQ7RTU9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
STRCQ7RTU9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
STRCQ7RTU9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
STRCQ7RTU9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
STRCQ7RTU9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
STRCQ7RTU9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
STRCQ7RTU9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
STRCQ7RTU9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
STRCQ7RTU9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
STRCQ7RTU9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
STRCQ7RTU9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
STRCQ7RTU9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
STRCQ7RTU9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
STRCQ7RTU9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
STRCQ7RTU9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
STRCQ7RTU9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
STRCQ7RTU9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
STRCQ7RTU9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
STRCQ7RTU9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
STRCQ7RTU9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
STRCQ7RTU9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
STRCQ7RTU9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
STRCQ7RTU9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
STRCQ7RTU9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
STRCQ7RTU9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
STRCQ7RTU9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
STRCQ7RTU9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
STRCQ7RTU9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
STRCQ7RTU9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
STRCQ7RTU9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
STRCQ7RTU9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
STRCQ7RTU9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC32.07■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC32.07■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC32.06■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
STRCQ7RTU9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms