Protein–RNA interactions for Protein: Q6WKZ4

RAB11FIP1, Rab11 family-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP1Q6WKZ4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP1Q6WKZ4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms